Collezione di Ditteri Sirfidi, derivata dai campionamenti effettuati per l'applicazione del metodo Syrph the Net per la valutazione dello stato di conservazione della biodiversità.
Collezioni "Lucchini" di Coleotteri Scarabeoidei (Artropodi: Insetti)
Collezione "Fanciulli" di Collemboli (Artropodi: Insetti)

La collezione, costituita da esemplari montati su vetrino, è stata prodotta in occasione del Corso di riconoscimento degli invertebrati terrestri dell'ottobre 1999 dal Dott. P. Paolo Fanciulli dell'Università di Siena. Comprende circa 42 specie, pari al 10% del totale delle specie italiane, e 162 individui.
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Elenco Collemboli
Collezione entomologica "Bortolotti" (Artropodi: Insetti)
Collezione entomologica "Grillenzoni" (Artropodi: Insetti)
Questa collezione comprende 1099 individui di 414 specie delle famiglie Carabidae, Haliplidae, Hygrobiidae, Girinidae, Dytiscidae, Trogidae, Geotrupidae, Scarabaeidae, Anthicidae, Coccinellidae.
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Elenco Coleotteri
Collezione Imenotteri (Artropodi: Insetti)
La collezione di Imenotteri del Museo comprende 358 individui di 92 specie delle famiglie Mutillidae e Sphecidae.
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Elenco Imenotteri
Collezione di Coleotteri Carabidi "C. Pesarini" (Artropodi: Insetti)